首都衛生發展科研專項（以下簡稱首發專項）是由財政科技經費支持，市衛生健康委按照行業、屬地管理原則組織實施，重點支持北京地區醫療衛生機構和醫學科研機構的在職人員開展臨床研究等應用研究為主的醫學創新活動。5月22日，市衛生健康委組織召開了2020年度首發專項項目申報啟動暨培訓會，北京地區醫療衛生機構及科研機構的科研管理和科研人員約1500余人參會。
會上，市衛生健康委科教處宋玫處長就首發專項管理要求以及2020年首發專項西醫類和轉化類項目申請指南進行了解讀，市中醫管理局王會玲處長對中醫藥類項目申請指南進行了講解，會議還邀請了北京市心肺血管疾病研究所趙冬教授、北京協和醫院劉曉清教授、北京兒童醫院彭曉霞教授針對提出、構建和選擇研究問題的基本原則，臨床研究標書撰寫的關鍵點等進行了講解。
會議同步印發了《首都衛生發展科研專項2020年申請指南》。2020年度首發專項將設立重點攻關、自主創新、基層普及和青年優才四類項目，支持廣大一線醫務人員開展臨床、公共衛生和醫藥管理方面的應用研究。為促進醫藥健康協同創新，首發專項在自主創新項目中增設了轉化項目，專門支持基于醫藥健康產品研發且具有市場應用前景的項目開展轉化研究工作。為鼓勵科研人員提高研究水平，首發專項建立了優秀項目滾動支持機制，以及對國家和北京市科技獎勵的獲獎單位另外增加申請項目名額的激勵機制。同時首次引入誠信懲戒措施，對存在科研誠信問題、既往首發項目實施不力的人員取消此次申請資格。2020年首發專項申請工作將通過個人申請、方法學評價、單位審核、形式審查、業務和預算聯合評審、部門審議、公示和簽訂任務書等程序予以立項。